目的研究重复经颅磁刺激联合综合康复训练对孤独症患儿的孤独症行为与认知功能的影响。方法选取兴国县妇幼保健院2018年1月至2020年3月收治的40例孤独症患儿,按照随机数字表法将其分为对照组与试验组,各20例。对照组患儿采用综合康复训练治疗,试验组患儿在对照组的基础上联合重复经颅磁刺激治疗,两组患儿均治疗6个月。比较两组患儿治疗前后孤独症评定量表（CARS）评分,孤独症行为量表（ABC）评分,格里菲斯发育评估量表（GDS-C）评分及血浆皮质醇（Cor）、脑源性神经营养因子（BDNF）、同型半胱氨酸（Hcy）水平。结果与治疗前比,治疗后两组患儿CARS、ABC评分及血浆Cor、Hcy水平均降低,且试验组低于对照组;与治疗前比,治疗后两组患儿个人-社会、听力语言、视觉表现评分及血浆BDNF水平均升高,且试验组高于对照组（均P<0.05）。结论重复经颅磁刺激联合综合康复训练可有效缓解孤独症患儿的临床症状,改善孤独症行为,同时通过调节大脑神经因子水平进而改善认知功能,促进患儿康复。